Se inaugura en 1970 coincidiendo con la celebración de la «Bienal de Arte Contemporáneo de Ibiza», impulsada por Florencio Armán y Lombarte.
El museo surge de la iniciativa de diversas instituciones: el Ayuntamiento de Ibiza, la Delegación Nacional de Cultura y la Asociación de Amigos de Ibiza y tiene como propósito dar a conocer la obra de artistas contemporáneos tanto nacionales como internacionales.
En cuanto a la ubicación, el museo ocupa varias edificaciones del recinto amurallado. Integran los fondos los trabajos premiados en las sucesivas bienales y los donados al museo por los propios artistas. Además de conferencias y conciertos, el museo acoge de forma regular muestras de carácter nacional e internacional.