El ministro de Educación, Cultura y Deporte y la consejera de Cultura de la Junta de Andalucía Rosa Aguilar, han firmado un protocolo por el que se fija el día 1 de marzo de 2016 como fecha a partir de la que la Consejería de Cultura de la Junta asumirá la gestión de la sede del Museo de Málaga.
Culminada la rehabilitación del edificio por parte del Ministerio, la Administración estatal continuará desarrollando los trabajos que son de su competencia: la instalación del proyecto museográfico y el equipamiento de las áreas públicas.